Virologie
université marie et pierre parie VI
Sommaire
11 Introduction
11 1 Introduction générale et buts de l’enseignement de la virologie en DCEM1
13 2 Conseils du Pr J.M. Huraux aux Étudiants pour les examens
14 3 Objectifs de l’enseignement de virologie aux étudiants en médecine
15 3.1 Objectifs généraux
16 3.2 Objectifs particuliers aux différents virus d’intérêt médical
24 3.3 Démarches diagnostiques, épidémiologiques et préventives
25 4 Liste de questions rédactionnelles pour l’examen de DCEM-1 2007
29 Chapitre 1 : Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des
infections virales
29 1.1 Qu’est-ce qu’un virus ?
30 1.1.1 Génome
31 1.1.2 Capside
31 1.1.3 Enveloppe ou péplos
35 1.1.4 Classification des virus
39 1.1.5 Agents des encéphalopathies spongiformes transmissibles ou ATNC (agents
transmissibles non conventionnels)
39 1.2 Multiplication des virus
39 1.2.1 Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
40 1.2.2 La multiplication d’un virus comporte six étapes
43 1.2.3 Conséquences de la multiplication virale pour la cellule infectée
46 1.3 Moyens de défense contre l’infection virale
46 1.3.1 À la frontière, la peau et les muqueuses
47 1.3.2 Immunité naturelle, innée
49 1.3.3 Immunité acquise, spécifique
53 1.3.4 Interactions et « ambivalence » des moyens de défenses
54 1.3.5 Immunodépression et infections virales
55 1.3.6 Échappement des virus aux défenses immunitaires
57 1.4 Expression clinique de l’infection
60 1.4.1 Infections aiguës
61 1.4.2 Infections chroniques
61 1.5 Lutte contre les infections virales
61 1.5.1 Immunothérapie passive
62 1.5.2 Immunothérapie active
63 1.5.3 Chimiothérapie antivirale
66 1.5.4 Mesures d’hygiène : last but not least
66 1.6 Points importants
69 Chapitre 2 : Les Herpesviridae - 1ère partie (HSV et VZV)
69 2.1 Généralités sur les Herpesviridae
75 2.2 Les deux virus de l’herpès, ou herpes simplex virus type 1 et type 2 (HSV-1,
HSV2)
76 2.2.1 L’HSV-1 et l’HSV-2 se partagent le corps
76 2.2.2 Manifestations habituelles des infections à HSV-1
79 2.2.3 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2)
79 2.2.4 Infections graves
82 2.2.5 Diagnostic au laboratoire de virologie des infections à HSV-1 et HSV-2
85 2.2.6 Traitement
86 2.2.7 Points importants
87 2.3 Virus de la varicelle et du zona (VZV)
87 2.3.1 Varicelle
89 2.3.2 Zona
90 2.3.3 Transmission de l’infection à VZV
90 2.3.4 Diagnostic
91 2.3.5 Traitement des infections à VZV
92 2.3.6 Points importants
95 Chapitre 3 : Les Herpesviridae - 2ème partie (CMV, EBV, HHV-6,
HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
95 3.1 Le cytomégalovirus humain (HCMV ou plus couramment CMV)
95 3.1.1 Le virus
96 3.1.2 Épidémiologie
97 3.1.3 Infection du nouveau-né
98 3.1.4 L’adulte immunocompétent
98 3.1.5 Les personnes immunodéprimées
99 3.1.6 Diagnostic au laboratoire
100 3.1.7 Prévention et traitement
102 3.1.8 Points importants
103 3.2 Le virus Epstein-Barr (virus E-B ou EBV)
103 3.2.1 Historique
103 3.2.2 Mononucléose infectieuse
105 3.2.3 Physiopathologie de la mononucléose infectieuse
106 3.2.4 Infection latente
107 3.2.5 EBV et cancer
109 3.2.6 Diagnostic de l’infection par EBV et de la mononucléose infectieuse au
laboratoire
110 3.2.7 L’EBV, outil de laboratoire
110 3.2.8 Points importants
111 3.3 Herpèsvirus humain type 6 ou HHV-6
111 3.4 Herpèsvirus humain type 8 ou HHV-8
112 3.5 Herpesvirus simiæ ou virus B du singe
113 Chapitre 4 : Rétrovirus humains - 1ère partie (le VIH ou HIV)
113 4.1 Introduction : généralités sur les rétrovirus
113 4.2 L’HIV ou VIH, virus de l’immunodéficience humaine
115 4.2.1 Structure du virus
117 4.2.2 Cycle de multiplication de l’HIV au niveau de la cellule
121 4.2.3 La multiplication virale au niveau de l’organisme
123 4.2.4 Épidémiologie
123 4.2.5 L’HIV-2
124 4.2.6 Diagnostic virologique et suivi au laboratoire de l’infection à VIH
127 4.2.7 Thérapeutique antivirale
131 4.2.8 Prospective
134 4.2.9 Points importants
137 Chapitre 5 : Rétrovirus humains - 2ème partie (HTLV) et virus des
hépatites - 1ère partie (hépatite A - VHA ou HAV,
hépatite B - VHB ou HBV)
137 5.1 Rétrovirus humains - 2ème partie : HTLV
139 5.2 Les « virus des hépatites »
139 5.3 Caractères généraux des hépatites virales aiguës
140 5.4 Le virus de l’hépatite A (VHA ou HAV)
141 5.5 Le virus de l’hépatite B (VHB ou HBV)
142 5.5.1 Structure du virus
143 5.5.2 Multiplication
144 5.5.3 La transmission de l’HBV
146 5.5.4 Histoire naturelle de l’infection et évolution des antigènes, des anticorps et
de l’ADN viral dans le sérum
150 5.5.5 Traitement
153 5.5.6 Un problème très important de santé publique
153 5.5.7 HBV et mutations
154 5.6 Points importants
155 Chapitre 6 : Virus des hépatites - 2ème partie
156 6.1 Le virus delta ou virus de l’hépatite D (HDV)
157 6.2 Le virus de l’hépatite C (HCV)
157 6.2.1 Le virus
159 6.2.2 Épidémiologie et histoire naturelle
161 6.2.3 Diagnostic
161 6.2.4 Le traitement
162 6.3 Le virus de l’hépatite E ou HEV
163 6.4 Le virus dit de l’hépatite G et le TTV
163 6.5 Points importants
165 Chapitre 7 : Les virus respiratoires - 1ère partie
165 7.1 Virus de la grippe ou virus influenza
166 7.1.1 Clinique de la grippe
166 7.1.2 Parcours du virus de la grippe dans l’organisme
167 7.1.3 Morts par grippe
169 7.1.4 Virus de la grippe ou virus influenza et modifications antigéniques
175 7.1.5 Diagnostic au laboratoire
176 7.1.6 Traitement et prévention de la grippe
179 7.1.7 Points importants
181 Chapitre 8 : Les virus respiratoires - 2ème partie.
Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubéole
181 8.1 Virus respiratoires (2ème partie)
181 8.1.1 Généralités sur la famille des Paramyxoviridae
182 8.1.2 Les virus para-influenza
184 8.1.3 Virus respiratoire syncytial
185 8.1.4 Coronavirus
186 8.1.5 Rhinovirus
186 8.2 Virus des oreillons ou virus ourlien
186 8.2.1 Le virus
187 8.2.2 Diagnostic virologique
187 8.2.3 Traitement
187 8.3 Virus de la rougeole
187 8.3.1 Manifestations cliniques
188 8.3.2 Diagnostic virologique
189 8.3.3 Vaccin
189 8.4 Points importants
190 8.5 Virus de la rubéole
190 8.5.1 Le virus
191 8.5.2 Primo-infection rubéolique
194 8.5.3 Réinfection rubéolique
195 8.5.4 Rubéole congénitale
196 8.5.5 Conduite à tenir chez une femme enceinte
198 8.5.6 Récapitulatif des dates des prélèvements et des indications de la recherche
des IgM rubéoliques
199 8.5.7 Traitement
200 8.5.8 Points importants
201 Chapitre 9 : Entérovirus et virus des gastroentérites
201 9.1 Entérovirus
201 9.1.1 Généralités sur les entérovirus
205 9.1.2 Poliomyélite et poliovirus
211 9.1.3 Échovirus et coxsackievirus
212 9.2 Virus des gastroentérites
212 9.2.1 Rotavirus
213 9.2.2 Petits virus nus à ARN responsable de gastroentérites
213 9.2.3 Adénovirus des gastroentérites
213 9.3 Points importants
215 Chapitre 10 : « Autres virus à ADN » : adénovirus, polyomavirus,
papillomavirus, parvovirus, poxvirus
215 10.1 Adénovirus
215 10.1.1 Clinique
217 10.1.2 Diagnostic au laboratoire
219 10.1.3 Pouvoir cancérigène des adénovirus
219 10.1.4 Traitement
220 10.2 Papovavirus
220 10.2.1 Généralités
220 10.2.2 Famille des Polyomaviridae
223 10.2.3 Famille des Papillomaviridae
226 10.3 Parvovirus
227 10.4 Poxvirus
227 10.4.1 Généralités
227 10.4.2 Variole
228 10.4.3 Vaccine
228 10.4.4 Actualité de la variole
229 10.4.5 Poxviroses professionnelles
229 10.4.6 Monkey pox
229 10.4.7 Molluscum contagiosum
230 10.5 Points importants
230 10.5.1 Adénovirus ou ADV
230 10.5.2 Polyomavirus humains, BK et JC virus
230 10.5.3 Papillomavirus humains ou HPV
231 10.5.4 Parvovirus humain B19
231 10.5.5 Poxvirus
233 Chapitre 11 : Agents des encéphalopathies spongiformes ou ATNC
(agents transmissibles non conventionnels)
233 11.1 Des maladies extraordinaires
233 11.2 Des agents extraordinaires
235 11.3 L’hypothèse du prion ou de la « protéine seule »
236 11.4 ESB et nvMCJ
237 11.5 Les différentes catégories de MCJ
239 Chapitre 12 : Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits émergents
239 12.1 Virus de la rage
239 12.1.1 Le virus rabique
240 12.1.2 Réservoir du virus
240 12.1.3 La contamination de l’homme
242 12.1.4 Trajet du virus
242 12.1.5 Signes de la rage
243 12.1.6 Mesure à prendre
246 12.1.7 Points importants
246 12.2 Arbovirus
246 12.2.1 Définition
247 12.2.2 Parcours habituel du virus dans l’organisme
248 12.2.3 Fièvre jaune (virus amaril)
250 12.2.4 Encéphalites à arbovirus
251 12.2.5 La dengue
252 12.2.6 Points importants
252 12.3 Infections à forte mortalité par filovirus, arénavirus, et hantavirus et autres
virus émergents
252 12.3.1 Les filovirus : le virus Marburg et le virus Ebola
253 12.3.2 Les arénavirus
254 12.3.3 Le virus Hantaan
254 12.3.4 Conditions de manipulation
254 12.4 En guise de conclusion au cours de virologie médicale
257 Annexe A : Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
261 Annexe B : Calendrier vaccinal 2005
261 B.1 Nouvelles recommandations
262 B.2 Recommandations générales
264 B.3 Risques professionnels
266 B.4 Recommandations particulières
268 B.5 Recommandations vaccinales aux voyageurs
269 Annexe C : Récapitulatif : diagnostic, prévention, traitement
271 Annexe D : Aide-mémoire de chimiothérapie antivirale
277 Annexe E : Les examens virologiques en pratique médicale
277 E.1 Diagnostic des infections virales
277 E.1.1 Deux approches
277 E.1.2 Diagnostic direct
285 E.1.3 Diagnostic indirect
290 E.2 Rôle du praticien
290 E.2.1 Les prélèvements
290 E.2.2 Renseignements cliniques et interprétation des résultats
291 E.2.3 Indication des examens virologiques en pratique médicale
292 E.3 Quantification de la virémie, « seuil d’intervention » et « traitement anticipé »
(preemptive)
294 E.4 Suivi des traitements antiviraux
296 E.5 Conclusion
297 Annexe F : Recommandations de traitement pour hépatite chronique
299 Annexe G : Vingt ans après
305 Annexe H : Évaluation de l’enseignement de la virologie. Année 2007
307 Annexe I : Remerciements
